Substrate binding sites in the 2-kinase domain of 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase
(1997)
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- La 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphate (PFK-2/FBPase-2) est l’enzyme bifonctionnelle qui catalyse la synthèse et la dégradation du fructose-2,6-biphosphate, un puissant régulateur de la glycolyse. Au cours de ce travail, nous avons tenté d’élucider les mécanismes moléculaires gouvernant la catalyse du domaine PFK-2. Nous avons d’abord démontré que, contraitement à ce qui avait été postulé, le mécanisme catalytique de la PFK-2 n’était en aucun point comparable à celui de la 6-phosphofructo-1-kinase (PFK-1). Nous avons dès lors réalisé une analyse théorique du domaine PFK-2 par alignements de séquences. Ceci a permis l’élaboration d’un modèle tridimentionnel de la PFK-2 en analogie avec l’adenylate kinase. Cette approche théorique nous a permis de repérer les résidus potentiellement impliqués dans le processus catalytique et/ou la liaison des substrats. Nous avons vérifié expérimentalement par mutagène dirigé que certains parmi ces acides aminés sont de fiat impliqués dans la liaison des deux substrats de la PFK-2. Cette approche expérimentale a confirmé la modèle tridimensionnel. Finalement, l’association de ces approches théoriques et pratiques nous a permis de proposer un modèle catalytique de la PFK-2
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Vertommen, D. (1997). Substrate binding sites in the 2-kinase domain of 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase. https://hdl.handle.net/2078.5/25361