Recherche de peptides cycliques inhibiteurs de la pompe d’efflux AcrAB-TolC conférant une résistance aux antibiotiques chez Escherichia coli
(2013)
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- Soumillion, Patrice
- Abstract
- (fr) Les pompes d’efflux sont à l'origine de nombreux phénomènes de résistance aux antibiotiques et sont considérées comme des cibles potentielles d’intérêt en pharmacologie. Notre projet visait à identifier, au sein de collections de peptides cycliques biosynthétisés par Escherichia coli, des inhibiteurs de sa principale pompe d'efflux, AcrAB-TolC, en utilisant une stratégie de sélection originale. Les peptides inhibiteurs d’AcrAB-TolC doivent rendre E. coli hypersensible aux antibiotiques substrats de la pompe. Pour pouvoir les identifier, nous avons utilisé l'oxacilline (un substrat de la pompe) pour lyser sélectivement les bactéries dont la pompe est inactive, récupérer les plasmides encodant les peptides inhibiteurs dans le surnageant et retransformer des nouvelles bactéries. Plusieurs protocoles ont d’abord été mis au point sur un système modèle avant de réaliser la sélection sur les banques de peptides cycliques. Un clone intéressant a pu être sélectionné au sein des collections mais son étude suggère que le peptide agit de manière indirecte sur l’activité de la pompe, peut-être en dissipant la force proton motrice nécessaire à l’activité de la pompe. Par ailleurs, nous avons également séquencé et caractérisé des peptides intrinsèquement bactériolytiques sélectionnés dans le cadre d’un autre projet. Une étude statistique de 65 clones montre que la majorité des peptides à effet bactériolytique sont hydrophobes et agissent sans doute par déstabilisation de la membrane interne. Ce n’est cependant pas le cas de trois peptides présentant les effets bactériolytiques les plus prononcés. Ces derniers pourraient donc agir de manière plus spécifique.
- Affiliations
Citations
Doumit, M. (2013). Recherche de peptides cycliques inhibiteurs de la pompe d’efflux AcrAB-TolC conférant une résistance aux antibiotiques chez Escherichia coli. https://hdl.handle.net/2078.5/203379